Przyczyny niepłodności mogą w równym stopniu leżeć po stronie kobiety jak i mężczyzny. W znacznej części przypadków
w niepłodności udział bierze zarówno czynnik męski jak i kobiecy. Natomiast kiedy znalezienie przyczyny niepłodności nie jest możliwe, mówimy o niepłodności niewiadomego pochodzenia (dawniej idiopatycznej), co dotyczy nawet do 15% par diagnozowanych z powodu niepłodności

Pośród wielu przyczyn mogących mieć wpływ na płodność kobiety warto wymienić kilka najczęściej spotykanych, takich jak:

• zaburzenia owulacji,
• przebyte zakażenia,
• niedrożności jajowodów,
• zrosty pooperacyjne,
• endometrioza,
• wrodzone nieprawidłowości w budowie narządu rodnego
• mięśniaki macicy
• wiek - odgrywa bardzo ważną rolę, gdyż płodność kobiety z roku na rok jest coraz mniejsza, a znaczny jej spadek obecny jest po 35 roku życia. Związane jest to głównie ze spadkiem liczby i jakości komórek jajowych oraz wzrostem poronień w bardzo wczesnym stadium rozwoju zarodka.

Nie bez znaczenia pozostaje także psychologiczny aspekt niepłodności. Jeśli długotrwałe leczenie tradycyjnymi metodami nie kończy się sukcesem tzn. urodzeniem dziecka, to u niepłodnych kobiet pojawia się frustracja o charakterze społecznym, psychicznym i egzystencjonalnym. Kobiety niepłodne często czują się nieakceptowane społecznie, wręcz napiętnowane, co wywołuje u nich niepokój, lęk, drażliwość, poczucie winy i krzywdy.

W przypadku mężczyzn niepłodność najczęściej jest następstwem następujących schorzeń:

• operacje przepukliny pachwinowej,
• przebyte zapalenia najądrza lub gruczołu krokowego,
• żylaki powrózka nasiennego,
• urazy jąder,
• niezstąpione jądra,
• choroby endokrynologiczne.

Kluczowe w ocenie płodności męskiej jest badanie nasienia. Ostatnie badania Światowej Organizacji Zdrowia wykazały udział mężczyzn w niepłodności połowy par. Najczęstszymi przyczynami okazywały się nieprawidłowości nasienia, takie jak: zbyt mała liczba plemników, ich nieprawidłowa ruchliwość lub morfologia.

Mężczyźni w sposób inny niż kobiety manifestują swoje trudności z uzyskaniem potomstwa. Zupełnie bezpodstawnie utożsamiają oni wydolność seksualną z płodnością, co potęguje ich zmartwienia. Niepłodni mężczyźni w trakcie leczenia wykazują się często wzmożoną aktywnością socjalną i zawodową.